SD Muhammadiyah 1 Lamongan telah menerapkan program Full Day School untuk meningkatkan kualitas pendidikan dan pengembangan karakter siswa. Program ini dirancang untuk memberikan pengalaman belajar yang lebih komprehensif dan mendalam bagi siswa, di mana mereka dapat belajar dengan lebih tenang dan tidak terburu-buru.

Program Full Day School di SD Muhammadiyah 1 Lamongan juga menekankan pada pembinaan karakter dan nilai-nilai keagamaan. Setiap hari, siswa mengikuti kegiatan shalat berjamaah, mengaji, dan berbagai kegiatan keagamaan lainnya yang membentuk sikap dan perilaku yang baik. Dengan demikian, siswa tidak hanya cerdas secara intelektual, tetapi juga memiliki akhlak yang mulia.